MODUS Jurnal Ekonomi dan Bisnis merupakan jurnal terbitan berkala ilmiah yang pertama kali diterbitkan pada tahun 1983 yang dikelola oleh Fakultas Ekonomi Universitas Atma Jaya Yogyakarta di bawah Fakultas Ekonomi di bawah pusat kegiatan pengembangan ilmu manajemen yang merupakan embrio dari Pusat Pengembangan Manajemen (PPM). PPM sendiri baru disahkan sebagai sebuah pusat kegiatan pada bulan September 1984 dengan Surat Keputusan Tanggal 21 September 1984 No. 344/Per/Pers/AY/IX/84 tentang Pembentukan Pusat Pengembangan Manajemen Fakultas Ekonomi Universitas Atma Jaya Yogyakarta dan kegiatan yang dilakukan salah satunya adalah pengelolaan jurnal ilmiah. PPM sendiri kemudian berganti nama menjadi Pusat Pengembangan Ekonomi dan Bisnis (PPEB) dan Jurnal MODUS masih dinaungi oleh lembaga ini sampai tahun 2014. Setelah itu, di tahun 2014, Jurnal MODUS kemudian kembali dikelola oleh Fakultas Ekonomi di bawah Wakil Dekan bidang akademik sampai sekarang dengan pengelolaan tersendiri oleh Pejabat Struktural yang ditunjuk oleh universitas.

Nama MODUS diberikan oleh Samuel Desuki seorang ahli statistik. Nama MODUS memiliki arti frekuensi yang sering muncul dalam kaitannya dengan ilmu statistika, harapannya dengan penamaan ini, Jurnal MODUS senantiasa menjadi jurnal yang terus-menerus diingat oleh para peneliti dan akademisi ketika akan mengembangkan masyarakat melalui tulisan. Perkembangan nama MODUS ini kemudian sedikit berubah di masa sekarang seiring dengan perpindahan pengelolaan dari PPEB menjadi di bawah Fakultas Ekonomi. Jurnal MODUS di bawah pengelolaan Fakultas Ekonomi yang menjunjung semangat Atma Jaya Yogyakarta, mengalami pergeseran makna. Arti nama MODUS berkembang menurut arti dalam Bahasa Indonesia secara umum yaitu suasana kejiwaan sehubungan dengan perbuatan atau cara menurut tafsiran penulis tentang apa yang dituliskannya. Maknanya adalah jurnal ini merupakan sebuah terbitan berkala ilmiah yang dapat digunakan sebagai salah satu cara atau sarana seorang peneliti, dosen, dan praktisi untuk mengungkapkan pemikirannya melalui tulisan yang mereka tafsirkan sendiri berdasarkan kerangka keilmuan, keahlian, dan pengalamannya. Makna sebuah sarana atau cara juga merupakan salah satu kekhasan tersendiri dari Universitas Atma Jaya Yogyakarta sebagai Universitas Katolik yang melayani dalam cahaya kebenaran. Dengan demikian, Jurnal MODUS diharapkan dapat menjadi sebuah cara atau sarana penyalur ilmu dan kebenaran dari masyarakat yang dikelola dengan baik oleh institusi untuk masyarakat itu sendiri.