Potensi Propolis Homotrigona apicalis Sebagai Inhibitor NLRP3 Pada Aterosklerosis: Studi in silico

Authors

  • Ika Widya Lestari Universitas Muhammadiyah Kalimantan Timur
  • Khalish Arsy Al Khairy Siregar Universitas Muhammadiyah Kalimantan Timur
  • Paula Mariana Kustiawan Universitas Muhammadiyah Kalimantan Timur

DOI:

https://doi.org/10.24002/biota.v10i3.10862

Keywords:

Atherosclerosis, Homotrigona apicalis, NLRP3, molecular docking, propolis

Abstract

Peradangan adalah respons perlindungan sistem imun terhadap  kekebalan rangsangan berbahaya. Aterosklerosis, penyakit pembuluh darah progresif yang ditandai penumpukan plak lemak dinding arteri, disebabkan oleh peradangan. NLRP3 berperan dalam berbagai penyakit inflamasi, termasuk aterosklerosis. Alternatif berbasis bahan alami seperti propolis Homotrigona apicalis dapat mengurangi peradangan dan mencegah perkembangan penyakit. Sebaliknya, obat antiinflamasi seperti NSAID dan steroid sering memiliki efek samping. Untuk pemahaman dari interaksi ini, digunakan pendekatan molekuler docking. Pendekatan ini memungkinkan penggunaan senyawa propolis H.apicalis sebagai antiinflamasi yang aman dan efektif. Dengan menggunakan metode molekuler docking, penelitian ini mengkaji potensi senyawa propolis H. apicalis sebagai penghambat jalur peradangan NLRP3 pada aterosklerosis. Senyawa dalam propolis, seperti Alpha-Amyrin dan Beta-Amyrin, menunjukkan aktivitas anti-inflamasi melalui interaksi hidrofobik dengan residu kunci pada protein NLRP3. Nilai afinitas ikatan tinggi Alpha-Amyrin (-10,7) kcal/mol dan Beta-Amyrin (-10,6kcal/mol), menunjukkan potensi penghambatan inflamasi yang efektif. Maka dapat disimpulkan bahwa Senyawa Alpha-Amyrin dan Beta-Amyrin dari propolis H. apicalis memiliki potensi sebagai penghambatan jalur inflamasi NLRP3 dalam aterosklerosis. Hal ini mengindikasikan Alpha-Amyrin sebagai kandidat yang sangat kuat dengan Beta-Amyrin sebagai senyawa pendukung dengan potensi serupa.

References

Abdul, Gapar, Nor, Adilah, Asem, Nornaimah, Abd, Hapit, Nor, Hussaini, MAS, Mohamed, Omar, Azam, & Eshaifol. (2023). Phytochemical profiling and anticancer activities of ethanolic and queous propolis extract of trigona apicalis. Journal of Health and Translational Medicine 1: 141–148. https://doi.org/10.22452/jummec.sp2023no1.13

Alsaedi, H. K., Alwan, N. A., & Al-Masoudi, E. A. (2024). Physiological and biochemical effect of α-Amyrin: A review. Journal of Medical and Life Science 6(3): 443–452.

Bąk, Urszula, Krupa, & Anna. (2023). Challenges and opportunities for celecoxib repurposing. Pharmaceutical Research 40(10): 2329–2345. https://doi.org/10.1007/s11095-023-03571-4

Cahyani, Putu, Yoga, Paramita, Ulandari, Sherly, Komang, Lestari, Madewidya, Nyoman, N., & Agustini, M. (2021). Efektivitas ekstrak propolis dalam penyembuhan. Ganesha Medicina Journal: 1(2): 80–90.

Candra, Gede, Ngurah, Hadi, Wijaya, Made, I, Al, Adnyana, Et, & Partha. (2021). Molecular docking kaempferol sebagai antiinflamasi pada aterosklerosis secara in silico. Jurnal Ilmiah Medicamento, 7(1): 13–18. https://doi.org/10.36733/medicamento.v7i1.1497

Chen, Ying, Ye, Xingyan, Escames, Germaine, Lei, Wangrui, Zhang, Xin, Li, Meng, Jing, Tong, Yao, Yu, Qiu, Zhenye, Wang, … Yang. (2023). The NLRP3 inflammasome: contributions to inflammation-related diseases. Cellular & Molecular Biology Letters 28(1): 51. https://doi.org/10.1186/s11658-023-00462-9

Demiati, R., Avimaro, R. A., & Kustiawan, P. M. (2024). Antioxidant activity of Homotrigona fimbriata propolis extract. Medical Sains : Jurnal Ilmiah Kefarmasian 9(1): 41–48. https://doi.org/10.37874/ms.v9i1.916

Dinata, I, D., Peni1, I, M., Asnawi1, Aiyi, Ligan, Identifikasi, Receptor, Angiotensin, Ii, Blocker, Pegagan, & Ekstrak, D. (2023). Identification of angiotensin receptor blocker ii ligands from gotu kola (Centella asiatica l.) Extract: an in silico study. Indonesian Journal of Pharmaceutical Science and Technology Journal Homepage 5(2): 196–206.

Effendi, N., Saputri, N. A., Purnomo, H., & Aminah, A. (2023). In silico ADME-T dan molekular docking analog tamoxifen sebagai kandidat agen terapi kanker payudara. Media Farmasi 19(1): 9. https://doi.org/10.32382/mf.v19i1.3305

Fadlan, Arif, Nusantoro, Yesaya, & Reformyada. (2021). The effect of energy minimization on the molecular docking of acetone-based oxindole derivatives. JKPK (Jurnal Kimia Dan Pendidikan Kimia) 6(1): 69. https://doi.org/10.20961/jkpk.v6i1.45467

Fakih, Muhammad, T., Putri, Prastowo, N. W. R., Marillia, Viola, Ramadhan, Fitra, D. S., Darusman, & Fitrianti. (2022). Identifikasi aktivitas biologis, prediksi toksisitas, dan molecular docking senyawa jubanine dari tanaman bidara arab sebagai kandidat antivirus SARS-CoV-2. Jurnal Riset Kimia 13(1): 111–121. https://doi.org/10.25077/jrk.v13i1.437

Gonzale, L., Irene, Amesty, Ángel, Estévez-Braun, Ana, Heras, de las, Beatriz, Hortelano, & Sonsoles. (2022). Dehydroisohispanolone as a promising NLRP3 inhibitor agent: bioevaluation and molecular docking. Pharmaceuticals 15(7). https://doi.org/10.3390/ph15070825

Hasan, R., I’anah, F. C., & Bahi, R. R. R. (2022). Docking molekuler senyawa potensial daun kelor (Moringa oleifera) terhadap reseptor folat. Journal of Innovation Research and Knowledge 2(2): 519–526.

Idacahyati, K., Nofianti, T., Aswa, G. A., & Nurfatwa, M. (2020). Hubungan tingkat kejadian efek samping antiinflamasi non steroid dengan usia dan jenis kelamin. Jurnal Farmasi Dan Ilmu Kefarmasian Indonesia 6(2): 56. https://doi.org/10.20473/jfiki.v6i22019.56-61

Ipav, S. S., Igoli, J. O., Tor-Anyiin, T. A., & Anyam, J. V. (2022). Isolation and characterisation of alpha and beta amyrins from propolis obtained from benue state. Journal of Chemical Society of Nigeria 47(2): 250–261. https://doi.org/10.46602/jcsn.v47i2.723

Ischak, Ino, Netty, Musa, JA, Weny, Aman, Ode, La, Alio, La, Kilo, La, Akram, Saleh, Deltalia, & Sri. (2023). Studi molecular docking dan prediksi adme senyawa metabolit sekunder tumbuhan obat tradisional gorontalo terhadap reseptor her-2 sebagai antikanker payudara. Jamb.J.Chem 5(1): 90–103.

Jabin, Anika, Uddin, Fahim, Mohammad, Azad, A., Salauddin, Rahman, Ashfaque, Tabassum, Fawzia, Sarker, Pritthy, Morshed, Helal, M, A. K., Rahman, Samiur, Raisa, … Maryam. (2023). Target-specificity of different amyrin subunits in impeding HCV influx mechanism inside the human cells considering the quantum tunnel profiles and molecular strings of the CD81 receptor: a combined in silico and in vivo study. In Silico Pharmacology 11(1): https://doi.org/10.1007/s40203-023-00144-6

Jusril, N. A., Mohd, K. S., Abd Mutalib, N., & Mohd Badiazaman, A. A. (2024). Chemical composition and pharmacological aspects of Malaysian stingless bee propolis: An up‑to‑date systematic review. Biomedical Reports, 22(1): 9. https://doi.org/https://doi.org/10.3892/br.2024.1887

Kim, & Sunghwan. (2021). Exploring chemical information in PubChem. Current Protocols 1(8). https://doi.org/10.1002/cpz1.217

Kong, P., Cui, Z. Y., Huang, X. F., Zhang, D. D., Guo, R. J., & Han, M. (2022). Inflammation and atherosclerosis: signaling pathways and therapeutic intervention. In Signal Transduction and Targeted Therapy 7(1). https://doi.org/10.1038/s41392-022-00955-7

Kustiawan, P. M., Luthfi M, C. F. M., Dewi, S. R., Pratiwi, J., Aisyiyah, N. M., Nugraha, A. S. D., & Setiawan, I. M. (2023). Phytochemical analysis and anti-inflammatory activity of the combination of Trigona apicalis propolis extract and honey. Borneo Journal of Pharmacy 6(2): 125–132. https://doi.org/10.33084/bjop.v6i2.4696

Litha, A., Abduh, I., Ilahi, K., Amini, A. R., Jurusan, D., Elektro, T., Negeri, P., Pandang, U. (2021). Karakterisasi antioksidan pada limbah sarang lebah Trigona spp. dengan metode GCMS. 1: 150–156.

Montero, Mora, M. A., Wardani, & Kusuma, A. (2024). In silico study of flavonoid compounds from dadap serep (Erythrina subumbrans) twigs and roots as antipyretics. Journal of Pharmaceutical and Sciences 7(1): 86–93.

Pharmacia, J., Waluya, M., Pharmacia, J., Waluya, M., No, V., Lestari, N. A., Isrul, M., Syah, D., & Ramadhan, F. (2024). Skrining virtual berbasis farmakofor dari database bahan alam sebagai inhibitor alosterik mutan t790m / c797 egfr untuk penemuan obat kanker paru pharmacophore-based virtual screening from natural compound database as c790m / c797 EGFR mutant allosteric I. Jurnal Pharmacia Mandala Waluya 3(3): 168–186.

Phuong, D. T. L., Van Phuong, N., Le Tuan, N., Cong, N. T., Hang, N. T., Thanh, L. N., Hue, V. T., Vuong, N. Q., Ha, N. T. T., Popova, M., Trusheva, B., & Bankova, V. (2023). Antimicrobial, cytotoxic, and α-glucosidase inhibitory activities of ethanol extract and chemical constituents isolated from homotrigona apicalis propolis—in vitro and molecular docking studies. Life 13(8): 1–14. https://doi.org/10.3390/life13081682

Prabhu, S. R. (2023). Inflammation: An Overview. In Textbook of General Pathology for Dental Students (pp. 41–47). Springer Nature: Switzerland. https://doi.org/10.1007/978-3-031-31244-1_6

Rushdi, A. I., Adgaba, N., Bayaqoob, N. I. M., Al-Khazim, A., & ... (2014). Characteristics and chemical compositions of propolis from Ethiopia. In SpringerPlus. Springer. https://doi.org/10.1186/2193-1801-3-253

Sen, D. J., Nandi, K., & Saha, D. (2021). Rule of five: the five men army to cross the blood brain barrier for therapeutically potent. World Journal of Advance Healthcare Research 5(3): 206–211.

Sukmawati, D. (2023). Peran penting inflamasom NLRP3 pada aterosklerosis. Jurnal Penyakit Dalam Indonesia 10(2). https://doi.org/10.7454/jpdi.v10i2.1417

Syahroni, E., Wisnuwardani, H. A., & Fakih, T. M. (2020). Studi in silico senyawa turunan phthalosianin terhadap reseptor hasap pada bakteri pseudomonas aeruginosa sebagai kandidat fotosensitizer. Prosiding Farmasi 6(2): 352–361.

Wulandari, Prasiska, Gabriel, Rizky, Nurdin, Aulia, Kevin, F., Hanna, Halwa, Pakhrul, Diffa, Harits, Salmandhiya, Prameswari, Sabiq, Pribadi, Agustina, Natashya, … Diah. (2023). Indonesian journal of chemical science in silico study of secondary metabolite compounds in parsley (Petroselinum crispum) as a drug terapy for blood cancer (Myeloproliferative Neoplasm (MPN)) targeting JAK-2. Indonesian Journal of Chemical Science 12(2): 216–228.

Xu, Xiaolin, Wu, Xianli, Yue, Gengyu, An, Qimin, Lou, Jun, Yang, Xiaoxu, Jin, Zhe, Ding, Jianhong, Hu, Yanxia, Du, … Rui. (2023). The role of Nod-like receptor protein 3 inflammasome activated by ion channels in multiple diseases. Molecular and Cellular Biochemistry 478(6): 1397–1410. https://doi.org/10.1007/s11010-022-04602-1

Yarlina, V. P. (2020). Kajian konsentrasi etanol dan metode ekstraksi propolis dari lebah jenis Trigona sp. Terhadap aktivitas antimikroba bakteri Escherichia coli dan beberapa karakteristik ekstrak propolis. Jurnal Teknologi & Industri Hasil Pertanian 25(1): 27. https://doi.org/10.23960/jtihp.v25i1.27-34

Yi, Xu, Yanling, Yang, Xi, Chen, Danling, Jiang, Fei, Zhang, Yao, Guo, Bin, Hu, Guohai, Xu, Shengliang, Peng, Lidong, … Hu. (2023). NLRP3 inflammasome in cognitive impairment and pharmacological properties of its inhibitors. Translational Neurodegeneration 12(1): 1–16. https://doi.org/10.1186/s40035-023-00381-x

Zainal, W. N. H. W., Azian, N. A. A. M., Albar, S. S., & Rusli, A. S. (2022). Effects of extraction method, solvent and time on the bioactive compounds and antioxidant activity of Tetrigona apicalis Malaysian propolis. Journal of Apicultural Research 61(2): 264–270. https://doi.org/10.1080/00218839.2021.1930958

Downloads

Published

30-10-2025

How to Cite

Lestari, I. W., Siregar, K. A. A. K., & Kustiawan, P. M. (2025). Potensi Propolis Homotrigona apicalis Sebagai Inhibitor NLRP3 Pada Aterosklerosis: Studi in silico. Biota : Jurnal Ilmiah Ilmu-Ilmu Hayati, 10(3), 282–294. https://doi.org/10.24002/biota.v10i3.10862